Factores asociados a la positividad de la PCR para SARS-CoV-2 en menores de 15 años / Related PCR positivity factors for SARS-CoV-2 in children under 15 years of age / Fatores associados à positividade da PCR para SARS-CoV-2 em crianças menores de 15 anos de idade

Introducción: la infección por SARS-CoV-2 en niños representa un porcentaje menor en la incidencia global de pacientes infectados por este virus. La prueba de reacción en cadena de polimerasa (PCR) para SARS-CoV-2 en muestra de secreciones nasofaríngeas es considerada como estándar de referencia, con niveles de sensibilidad y especificidad superiores a otras técnicas. Objetivo: describir las características de los pacientes menores de 15 años a los que se realizó PCR para SARS-CoV-2 en un prestador privado de salud del interior del país entre el 1° julio 2020 y el 30 de abril 2021. Analizar posibles factores asociados a la positividad de la prueba. Describir las características de los casos con PCR positiva Metodología: estudio observacional prospectivo con un análisis retrospectivo de tipo caso-control, a partir del seguimiento de una cohorte de menores de 15 años a los que se les realizó una prueba de PCR para SARS-CoV-2 en el período analizado, en un prestador integral de salud privado del interior del país. Se recabaron datos durante el seguimiento de los pacientes de acuerdo a un protocolo institucional que incluye: datos patronímicos, causa de la solicitud de la PCR, características del contacto, resultado de PCR y umbral de ciclo (CT), manifestaciones clínicas y evolución. Resultados: se solicitaron 2.361 PCR a menores de 15 años (15% del total de las PCR de la institución). Promedio de edad: 8,6 años (rango 7 días-14 años y 11 meses); 49% niñas y 51% varones. Motivo de solicitud de la prueba: 78,4% para estudio de contacto, 14,3% por síntomas sin noción de contacto y 7,3% previo a ingreso hospitalario (de urgencia o coordinación). Porcentaje de positividad de todo el período: 14,7%, con una importante variabilidad mensual (5,6% en diciembre y 27% en abril). La PCR fue positiva en 346 casos, con CT promedio de 27, y rango entre 16,8 y 37,3. No se encontraron diferencias estadísticas en relación a la edad y sexo entre casos positivos y negativos. Solo un caso fue PCR positivo previo al ingreso hospitalario (OR 0,03; IC 95% 0,004-0,22) y 20 de las 611 PCR solicitadas por contacto institucional (escolar, deportivo, etc.), siendo la diferencia estadísticamente significativa cuando el caso era mayor de 15 años (p 0,029). Del estudio retrospectivo de casos (PCR positiva) y controles (PCR negativa) surge una asociación estadísticamente significativa (p<0,000001) con la causa de solicitud por contacto en comparación con otra causa (OR 5,2; IC 95% 3,28-8,26), que el caso índice sea mayor de 15 años (OR 4,57 IC 95% 2,95 - 7,10) y que sea conviviente (OR 5,28 IC 95% 3,97 - 7,04). No hubo hospitalizaciones ni fallecimientos por COVID en la población analizada. Conclusiones: el testeo de niños y adolescentes en busca de COVID 19 continúa siendo una estrategia válida cuando existen síntomas sugestivos o contacto con un caso confirmado. En este estudio, los niños con antecedente de contacto con conviviente positivo, y mayor de 15 años, mostraron una mayor proporción de resultados positivos de PCR para SARS-CoV-2.

Introduction: the SARS-CoV-2 infection has shown a lower percentage in children compared to the global incidence of patients infected by this virus. The Polymerase Chain Reaction (PCR) test for SARS-CoV-2 in a sample of nasopharyngeal secretions is considered the reference standard test, and it has shown higher sensitivity and specificity levels than other techniques. Objective: describe the characteristics of patients under 15 years of age who underwent PCR for SARS-CoV-2 in a private health provider in the interior of the country between July 1, 2020 and April 30, 2021. Analyze possible factors linked to test positivity. Describe the characteristics of cases with positive PCR Methodology: prospective observational study with a retrospective case-control analysis based on the follow-up of a cohort of children under 15 years of age who underwent a PCR test for SARS-CoV-2 in the period analyzed, at a private health provider in the interior of Uruguay. Data were collected during patients' follow-up according to the institutional protocol that includes: personal data, reason for requesting the PCR, contact data, PCR result and cycle threshold (CT), clinical manifestations and evolution. Results: 2,361 PCRs were performed to children of under 15 years of age (15% of all PCRs in the institution). Average age 8.6 years (range 7 days - 14 years and 11 months); 49% girls and 51% boys. Reason for requesting the test: 78.4% due to previous contact, 14.3% due to symptoms without knowledge of contact and 7.3% prior to hospital admission (emergency or scheduled). Positivity percentage for the entire period 14.7% with significant monthly variability (5.6% in December and 27% in April). The PCR was positive in 346 cases, with a mean CT of 27, and a range between 16.8 and 37.3. No statistical differences were found regarding age and sex between positive and negative cases. Only 1 case was positive PCR prior to hospital admission (OR 0.03 95% CI 0.004 - 0.22) and 20 out of the 611 PCR were requested due to prior institutional contact (school, sports centers, etc.), the difference being statistically significant when the patient was older than 15 years (p 0.029). From the retrospective study of cases (PCR positive) and controls (PCR negative), a statistically significant link (p<0.000001) arose regarding: when the request resulted from a prior contact compared to other causes (OR 5.2 CI 95% 3.28-8.26), when the index case was older than 15 years of age (OR 4.57 95% CI 2.95-7.10) and when the patient and the contact had cohabited (OR 5.28 95% CI 3.97-7.04). There were no hospitalizations or deaths from COVID in the population analyzed. Conclusions: testing children and adolescents for COVID 19 continues to be a valid strategy in case of suggestive symptoms or contact with a confirmed positive case. In this study, children with a history of contact with a positive case, and older than 15 years, showed a higher proportion of positive PCR results for SARS-CoV-2.

Introdução: a infecção por SARS-CoV-2 em crianças representa um percentual menor do que na incidência global de pacientes infectados por esse vírus. O teste de reação em cadeia da polimerase (PCR) para SARS-CoV-2 em uma amostra de secreções nasofaríngeas é considerado o padrão de referência, com níveis de sensibilidade e especificidade mais elevados do que outras técnicas. Objetivo: descrever as características dos pacientes menores de 15 anos de idade que realizaram PCR para SARS-CoV-2 em uma prestadora de saúde privada do interior do país entre 1º de julho de 2020 e 30 de abril de 2021. Analisar possíveis fatores associados à positividade do teste. Descrever as características dos casos com PCR positivo. Metodologia: estudo observacional prospectivo com análise retrospectiva caso-controle a partir do acompanhamento de uma coorte de crianças menores de 15 anos que realizaram teste de PCR para SARS-CoV 2 no período analisado, em uma assistência médica de saúde no interior do país. Os dados foram coletados durante o acompanhamento dos pacientes de acordo com o protocolo institucional e incluíram: informação pessoal, motivo da solicitação do PCR, características do contato, resultado do PCR e limiar de ciclo (CT), manifestações clínicas e evolução. Resultados: foram solicitados 2.361 PCRs de menores de 15 anos (15% do total de PCRs da instituição). Idade média 8,6 anos (variação 7 dias - 14 anos e 11 meses); 49% meninas e 51% meninos. Motivo do pedido do exame: 78,4% por estudo de contato, 14,3% por sintomas sem conhecimento de contato e 7,3% antes da internação (por emergência ou coordenação). Porcentagem de positividade para todo o período 14,7% com significativa variabilidade mensal (5,6% em dezembro e 27% em abril). O PCR foi positivo em 346 casos, com média de TC de 27 e variação entre 16,8 e 37,3. Não foram encontradas diferenças estatísticas em relação à idade e sexo entre os casos positivos e negativos. Apenas 1 caso foi PCR positivo antes da admissão hospitalar (OR 0,03 IC 95% 0,004 - 0,22) e 20 dos 611 PCR solicitados por contato institucional (escola, centros de esportes, etc.), sendo a diferença estatisticamente significativa para os casos que tinham mais de 15 anos de idade (p 0,029). Do estudo retrospectivo de casos (PCR positivo) e controles (PCR negativo), emergiu uma associação estatisticamente significativa (p <0,000001) quando: a causa da solicitação do teste tinha sido um contato positivo prévio em relação a outra causa (OR 5,2 IC 95% 3,28 - 8,26), e quando o caso índice era mais velho do que 15 anos (OR 4,57 IC 95% 2,95 - 7,10) ou coabitava com o paciente (OR 5,28 IC 95% 3,97 - 7,04). Não houve internações ou óbitos por COVID na população analisada. Conclusões: a testagem de crianças e adolescentes em busca de COVID-19 continua sendo uma estratégia válida quando há sintomas sugestivos ou contato com um caso positivo confirmado. Neste estudo, crianças com histórico de contato com casos positivos na mesma casa e mais velhos do que 15 anos de idade apresentaram maior proporção de resultados positivos de PCR para SARS-CoV-2.

Afinidad entre las pruebas PCR y Antígeno, y su positivad para COVID-19 en Colombia / Affinity between the PCR and antigen tests and their positivity for COVID-19 in Colombia

Introducción: : El síndrome respiratorio agudo severo por coronavirus (SARS-CoV-2), el virus que origina la enfermedad 2019 (COVID-19) se ha diseminado con rapidez por todo el mundo desde que surgió en Wuhan, China, a finales de 2019. Objetivo: describir el comportamiento de positividad de muestras tomadas para SARS-CoV-2. Metodología: esta investigación se centró en las muestras de PCR y antígeno procesadas para COVID-19, con la información proveniente del Instituto Nacional de Salud en el periodo comprendido entre el 1 de enero a 31 de marzo 2021. Resultados: para la prueba de PCR en cada uno de los meses de enero a marzo 2021 en Colombia, se detalló que los días con mayor porcentaje de casos positivos fueron 12 de enero 56,3%, 7 de enero 44,9%, 6 de enero 45,1%, 5 de enero 43,7%, 2 de enero 38,1%, 24 de marzo 35,2%, y 26 de marzo con 31,3%. Para la prueba de antígeno en cada uno de los meses de enero a marzo 2021 en Colombia, se anota que los días con mayor porcentaje de casos positivos fueron 11 de enero 32,7%, 4 de enero 31,0%, 15 de enero 28,9%, 18 de enero 22,4%, 22 de marzo 21,1%, 28 de marzo 20,7%, y 17 de febrero 20,1%. Conclusión: hay que continuar la búsqueda activa de contagiados a través de la práctica de mayor número de pruebas de PCR, antígeno viral y molecular, la última con un alto nivel de precisión por parte de las EPS, y que a su vez aceleren el proceso de entrega de resultados.

Introduction: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), the virus that causes coronavirus disease 2019 (COVID-19) has spread rapidly around the world since it emerged in Wuhan, China, in late 2019. Objective: to describe the positivity rates of samples tested for SARS-CoV-2. Methodology: the research focused on PCR and antigen tests processed for COVID-19, using the information released by the National Institute of Health between January 1 and March 31 2021. Results: the highest positivity rate for PCR testing for each month between January to March 2021 in Colombia was found on the following days: January 12: 56.3%, January 7: 44.9%, January 6: 45.1%, January 5: 43.7%, January 2: 38.1%, March 24: 35.2% and March 26: (31.3%. The days with the highest percentage of positive cases found by antigen testing for each month from January to March 2021 in Colombia, were January 11: 32.7%, January 4: 31.0%, January 15: 28.9%, January 18: 22.4%, March 22: 21.1%, March 28: 20.7% and February 17: 20.1%. Conclusion: an active search of infected people must be continued through the practice of a greater number of PCR and viral antigen and molecular tests. The latter has been reported by the EPS to show very high accuracy, which accelerates the result delivery process.

O efeito da testagem laboratorial nos indicadores de acompanhamento da COVID-19: uma análise dos 50 países com maior número de casos / El efecto de las pruebas de laboratorio en los indicadores de seguimiento de COVID-19: un análisis de los 50 países con el mayor número de casos / The effect of laboratory testing on COVID-19 monitoring indicators: an analysis of the 50 countries with the highest number of cases

Objetivo: Analisar como a testagem da população influencia os indicadores de saúde usados para monitorar a pandemia de COVID-19 nos 50 países com maior número de casos diagnosticados. Métodos: Estudo ecológico sobre dados secundários, extraídos em 19/08/2020. Foram calculadas incidência acumulada, taxa de mortalidade, letalidade e proporção de testes positivos. Os dados foram descritos e apresentados graficamente, com o respectivo coeficiente de correlação de Spearman. Resultados: A taxa de testagem variou enormemente entre os países. A incidência acumulada e a proporção de testes positivos foram correlacionadas ao número de testes, enquanto a taxa de mortalidade e a letalidade apresentaram correlação baixa com esse indicador. Conclusão: A maioria dos países não testa o suficiente para garantir adequado monitoramento da pandemia, com reflexo na qualidade dos indicadores. A ampliação do número de testes é fundamental; porém, ela deve ser acompanhada de outras medidas, como isolamento de casos diagnosticados e rastreamento de contatos.

Objetivo: Analizar cómo el testeo poblacional influye en los indicadores de salud utilizados para monitorear la pandemia de COVID-19 en los 50 países con mayor número de casos diagnosticados. Métodos: Estudio ecológico, con datos secundarios, recogidos el 19/8/2020. Se calcularon la incidencia acumulada, la tasa de mortalidad, la letalidad y la proporción de pruebas positivas. Los datos fueron descritos y presentados gráficamente, con el respectivo Coeficiente de Correlación de Spearman. Resultados: La tasa de testeo varió enormemente entre los países. La incidencia acumulada y la proporción de pruebas positivas se correlacionaron con el número de pruebas, mientras que la tasa de mortalidad y de letalidad mostraron una baja correlación con este indicador. Conclusión: La mayoría de los países no realizan suficientes pruebas para garantizar un seguimiento adecuado de la pandemia, lo que se refleja en la calidad de los indicadores. La ampliación del número de pruebas es fundamental, y debe ir acompañada de aislamiento de casos y seguimiento de contactos.

Objective: To analyse how testing the population influences the health indicators used to monitor the COVID-19 pandemic in the 50 countries with the highest number of diagnosed cases. Methods:This was an ecological study using secondary data retrieved on 8/19/2020. Cumulative incidence, mortality rate, case-fatality rate, and proportion of positive tests were calculated. The data were described and presented graphically, with their respective Spearman Correlation Coefficients. Results: The testing rate varied enormously between countries. Cumulative incidence and the proportion of positive tests were correlated with the number of tests, while the mortality rate and case-fatality rate showed low correlation with this indicator. Conclusion: Most countries do not test enough to ensure adequate monitoring of the pandemic, and this is reflected in the quality of the indicators. Expanding the number of tests is essential, but it needs to be accompanied by other measures, such as isolation of diagnosed cases and contact tracing.